Tym razem chciałbym napisać parę słów o flatfile, czy o formacie używanym przez kilka dużych baz danych takich jak DDBJ, GenBank(należący do zespołu baz NCBI), EBI. Relacje między indywidualnymi formatami flatfile zapewniają efektywność w wymianie informacji między tymi bazami danych. Flatfile stosowany przez DDBJ i GenBank jest prawie identyczny, natomiast wykorzystywany przez EBI różni się [...]
PDB w skrócie, a dokładnie The Protein Data Bank to w biologii strukturalnej powszechnie znane repozytorium danych o strukturze trójwymiarowej dużych cząsteczek (np. białek) uzyskanych metodą rentgenografii strukturalnej lub spektroskopii NMR i zamieszczanych w internecie przez naukowców z całego świata. Pliki z zapisaną strukturą w specjalnym formacie .pdb są dostępne za darmo a zawartość baz [...]
Ostatnio, w celach edukacyjnych (sesja) przeszukiwałam internet. Oto co znalazłam o cyklach i szlakach biochemicznych i metabolicznych (Biochemical Pathways, Metabolic Pathways): Cyfrowa wersja planszy, wyprodukowanej przez firmę Roche. W pierwszym momencie może przyprawić o zawrót głowy uzupełniona o milszą już dla oka wyszukiwarkę. Całość jest na tyle intuicyjna, że nie wymaga instrukcji obsługi, umieszczona na [...]
Najnowsze komentarze