„Prediction of Protein Structures, Functions and Interactions”

Data wydania: Grudzień 2008

Redakcja: prof. dr hab. Janusz Bujnicki

Rosnąca fala  nowych danych badawczych tworzonych przy sekwencjonowaniu genomu nadaje impetu rozwojowi zautomatyzowanych metod przewidywania  dla funkcji białek, które zostały wywnioskowane na podstawie analiz sekwencji oraz braku charakterystyki badawczej.

„Prediction of Protein Structures, Functions and Interactions” przedstawia wyczerpujący przegląd  metod przewidywania struktur i funkcji białek z naciskiem na ich dostępność i możliwości łączenia. Metody modelowania indywidualnych białek, przewidywanie ich interakcji oraz  łączenia w struktury są  przedstawione w kontekście przewidywania ontologii genów (proces biologiczny, funkcja molekularna i komponenty komórkowe) i omówione w świetle ich udziału w wyłaniającej się dziedzinie biologii systemowej.  Tematy zawarte w książce obejmują:

• pierwsze kroki w analizie sekwencji białek i przewidywaniu struktur
• automatyczne przewidywanie funkcji białek z sekwencji
• oparte na szablonie przewidywanie  trójwymiarowych struktur białek: „rozpoznawanie pofałdowania” i modelowanie homologiczne
• pozostałe nieszablonowe przewidywanie trójwymiarowych struktur białek
• przewidywanie interakcji na poziomie molekularnym: od małych ligand do złożonych kompleksów białkowych
• połączenia makromolekularne
• integrowanie przewidywania struktur, funkcji i interakcji

„Prediction of Protein Structures, Functions and Interactions” skupia się na metodach używanych w technikach CASP które są wciąż rozwijane i  utrzymywane, i łatwo dostępne  dla badaczy akademickich zarówno jako serwery sieci web jak i programy używane lokalnie.  Jest to  niezbędny przewodnik po najnowszych, najlepszych metodach przewidywania struktur i funkcji białek dla badaczy,  studentów zaangażowanych w pracę w bioinformatyce strukturalnej, chemii białek, biologii strukturalnej i odkrywaniu nowych leków.

(prof. Bujnicki otrzymał za książkę nagrodę indywidualną w zakresie osiągnięć naukowych I stopnia od Ministra Nauki i Szkolnictwa Wyższego w roku 2009)

Książka raczej niedostępna w księgarniach polskich, niektóre biblioteki uniwersyteckie posiadają jej egzemplarze, w okresie dostępności kosztowała ok. 390 zł.