Bioinformatyk.eu nowy serwis o bioinformatyce i programowaniu

Konektomika, czyli dział neuronauk zajmujący się śledzeniem – metaforycznie to ujmując – autostrad, dróżek i ścieżek łączących neurony i ich skupiska w układzie nerwowym, jest bardzo młodą dyscypliną nauki. Wszystko w tej raczkującej dziedzinie błyszczy nowością, zarówno metodologia jak i skromne sukcesy mają wciąż charakter przyczynkarski, a większość naukowców zajmujących się badaniami w tym obszarze [...]

Many RNA molecules are posttranscriptionally modified. This means that specific positions in the RNA chain are chemically changed by enzymes, mostly adding extra chemical groups. RNA modifications are most abundant in tRNA, where about 20% of the residues are modified. They stabilize the tRNA tertiary structure, increase the accuracy of recognition by proteins from the [...]

Base pairs are the most important interaction found in folded RNA. Formed by hydrogen bonding, both classical Watson-Crick pairs (A-U, G-C) and wobble base pairs (G-U) can be found frequently – the bases then are oriented in the same way as in DNA. These are termed canonical base pairs (70%). Less frequently (30%), the nucleotide [...]

A very useful model of RNA structure is considering only the Watson-Crick base pairs (G+C, A+U, and the Wobble base pair G+U). These are also called canonical base pairs and define the secondary structure or 2D structure of an RNA molecule. In the secondary structure, characteristic elements can be identified: helical stems, loops, bulges, internal [...]