13 kwi, 2010
Politechnika: Algorytmy dla biologów
Zamieszczony przez: Justi w: Bioinformatyka|Studia|Z sieci
„Matematyka interesowała mnie od zawsze, mimo to bardzo długo nie mogłam zdecydować się na kierunek studiów. Czysta matematyka teoretyczna, oderwana od praktycznych zastosowań, jest interesująca, ale wolałam swoje życie zawodowe ukierunkować bardziej praktycznie. Stąd wziął się wybór kierunku studiów – informatyka na Politechnice Poznańskiej.
Biologią molekularną zaczęłam interesować się na trzecim roku studiów i miałam nadzieję, że w przyszłości uda mi się połączyć te dwie dziedziny wiedzy w swojej pracy. Udało się, gdyż kilka miesięcy później prof. Jacek Błażewicz zaproponował pierwszy na Politechnice temat z zakresu bioinformatyki. Wspólnie z biochemikami z Instytutu Chemii Bioorganicznej PAN w Poznaniu stawialiśmy pierwsze kroki w tym obszarze badawczym. Bioinformatyka to informatyka i matematyka zastosowane do problemów biologicznych. Trzeba pamiętać, że nie jest to jedynie implementacja programów, podstawa bioinformatyki to teoria matematyczna gwarantująca poprawność konstruowanych algorytmów. Twierdzenia matematyczne, nowe lub już istniejące w teorii, stosuje się do modelowania procesów biologicznych. Kiedy znajdzie się już takie matematyczne ujęcie, można napisać algorytm, program, który dany problem rozwiązuje. Rezultaty tej pracy najbardziej przydają się biologom molekularnym, którzy przeprowadzają eksperymenty w laboratoriach i otrzymują ogromną ilość informacji. Eksperymenty te, jak wszystkie, są obarczone błędami. Przetwarzanie takiej informacji jest w obecnych czasach praktycznie niemożliwe bez zastosowania narzędzi i metod informatycznych.
Komputery weszły na stałe do laboratoriów biologicznych. Nawet maszyny realizujące bardzo zaawansowane eksperymenty biologiczne są już zintegrowane z komputerem. Taki sprzęt pobiera próbki biologiczne, przetwarza je i dzięki programom stworzonym przez bioinformatyków przedstawia biologom gotowe rozwiązanie. Moja praca polega na tworzeniu teorii matematycznej oraz projektowaniu nowych algorytmów. Często dopracowanie szczegółów algorytmu trwa bardzo długo, nawet kilka lat, i jest to zazwyczaj praca zespołowa także z udziałem biologów służących swoją wiedzą ekspercką.”
Dr hab. inż. Marta Kasprzak, profesor nadzwyczajny w Instytucie Informatyki
źródło: http://www.dziewczynynapolitechniki.pl/
Najnowsze komentarze